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宏基因组

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项目介绍

宏基因组学(Metagenomics)研究通过全基因组鸟枪法(Whole Genome Shotgun，WGS)测序策略，将提取获得的微生物组总DNA随机打断为短片段，并构建合适长度的插入片段文库，对这些文库进行双端(Paired-end，PE)高通量测序，从而能精细地展示整个菌群的功能代谢谱和物种精细组成谱，进而在组成和功能水平分别挖掘关键生物标记物，从原理上阐明微生物群落在生态系统中发挥作用的根本机制。

技术路线：

样品要求

1.DNA：DNA浓度>20ng/ul，体积大于20ul；并确保DNA无降解，无污染；

2.环境样本：土壤5-10 g，污泥/沉积物5-10 g，水体-滤膜过滤至有可见覆盖物，粪便3-5 g，血液10 mL；

3.样本处理时，需避免污染，保存期间切忌反复冻融，且需要干冰寄送的样本，请提前自行准备干冰。

项目案列

基于GraPhlAn的样本总体分类等级树图

种水平的优势微生物关联网络图

Top50差异物种的聚类热图

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