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SmallRNA

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项目介绍

Small RNA是一大类调控分子，几乎存在于所有的生物体中。Small RNA包括：microRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等等。Small RNA通过多种多样的作用途径，包括mRNA降解、翻译抑制、异染色质形成以及DNA去除，来调控生物体的生长发育和疾病发生。Small RNA转录组测序是鉴定和定量解析small RNA的新方法和有力工具。

技术特点

1.可以直接从核苷酸水平上研究Small RNA分子，不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题，非常利于区分相同家族以及序列极为相似的不同Small RNA分子；

2.可以对任意物种进行高通量分析，无需任何预先的序列信息以及二级结构信息。

3.灵敏度高，测序通量大，为Small RNA分子的发现和研究提供了极大的数据深度与覆盖率，能够检测丰度极低的稀有转录；

4.测序产生的原始数据可以与多种分析软件兼容，可以注释Small RNA的基因组信息，并分析其表达水平，能够随时使用公用Small RNA数据库注释已知的Small RNA，还可以进一步分析未匹配的数据，发现新的Small RNA种类及异构体，寻找更深入的研究信息。

实验流程

图中深色为该实验流程

分析流程

标准分析

（1）数据过滤及比对

（2） MicroRNA的比对分析及预测

高级分析

（3） MicroRNA表达水平分析

（4）MicroRNA表达差异性分析

样品要求

送样要求

RNA浓度≥200ng/ul，总量≥2ug

细胞数≥5ⅹ10⁶

项目案列

对68个标本的聚类分析

亚型差异表达维恩图分析

差异表达基因热图分析

常见问题

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