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二级结构预测

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项目介绍

     二级结构是指多肽链借助于氢键沿一维方向排列成具有周期性的结构的构象,是多肽链局部的空间结构(构象), 主要有α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲(Coil)三种形式。不同蛋白质翻译后修饰发生位置在蛋白二级结构上具有一定差异化选择。例如在某些情况下,蛋白质的磷酸化位点倾向于发生在无规则卷曲区域内;而在其他情况下,则倾向发生在结构良好的区域。该分析结果用于评估修饰蛋白中修饰氨基酸二级结构的偏好性选择。

分析方法

      采用 NetSurfP1.0 软件进行二级结构分析,然后 Wilcoxon Rank Sum 检验方法计算显著差异变化 p value。


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