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    项目介绍

         蛋白质乙酰化修饰由乙酰基转移酶和去乙酰化酶共同调节,通过感应代谢环境变化而变化,同时其常在代谢酶上发生修饰,进而调控代谢通路及代谢酶的活性,参与下游代谢物变化。蛋白质乙酰化(acetylation)是最常见的酰化修饰类型,是指在乙酰基转移酶的催化下把乙酰基团(如乙酰辅酶A等供体)共价结合到底物蛋白质的赖氨酸残基上的过程,主要发生在蛋白质赖氨酸残基的ε-NH2位,其分子质量会相应增加42.01Da,质谱能够准确地测定分子量是否发生相应的质量偏移,实现酰化修饰肽段及位点的分析。 4D-label free乙酰化修饰蛋白组学是基于timsTOF Pro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行乙酰化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

    技术路线

    技术优势

    1. 4D技术加持,提高定量的准确性、鉴定深度,更加适合微量样本;

    2. 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便;

    3. 基于质谱平台(Bruker timsTOF pro),检测速度提升近一倍;

    4. 经验丰富——超18年蛋白平台服务经验,拥有丰富的高水平项目文章;

    5. 数据保证——采用进口金标抗体,数据结果稳定可靠;

    6. 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析,实现快捷”一站式”服务。

    数据分析

    1、标准数据分析内容

    鉴定分析:鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图。

    表达差异分析:差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图。

    多组的比较分析(组别>=3):mufzz聚类;雷达图;箱线图。

    功能分析:亚细胞定位;结构域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作网络分析。

    质量控制分析:肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布。

    2、高级数据分析

    功能分析:GSEA富集分析。

    临床药物研究:药物靶点注释。

    标志物筛选:集成机器学习。

    与临床表征的联合分析:热图;弦图;ROC分析;WGCNA分析。

    推荐组合产品

    打通表型-机制研究:乙酰化组+代谢组。

    推荐应用领域

    能量代谢调控;

    代谢综合征研究;

    真菌细菌研究。

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