快捷下单入口 关于 合作 招聘 新人手册 会员中心

    热线：400-152-6858

    测试狗科研服务

    预存 免费试测 登录
    Document
    当前位置：文库百科 › 文章详情
    一文详解微生物群落多样性测序与功能分析
    来源： 时间：2023-11-14 11:10:25 浏览：3077次

    一文详解微生物群落多样性测序与功能分析

     

    微生物群落多样性测序与功能分析是研究微生物生态学的重要手段，随着高通量测序技术的发展，基于 16S rRNA 基因的测序技术在微生物群落多样性研究中受到广泛关注。

     

     微生物测序

     

    一、微生物群落多样性测序方法

    微生物群落多样性测序主要包括两类：一类是通过 16S rRNA、18S rDNA、ITS 区域进行扩增测序分析微生物的群体构成和多样性；另一类是宏基因组测序，不经过分离培养微生物，而对所有微生物 DNA 进行测序。

    16S rRNA 基因测序是目前应用最广泛的方法，它具有以下优势：

    1. 16S rRNA 基因普遍存在于细菌和古细菌中，具有多个拷贝数，全长约 1500 bp，其结构由 9 个可变区（variable region）和 10 个保守区（conserved region）交替组成；保守区有利于扩增引物的设计，可变区体现了物种间的进化差异。

    2. 16S rRNA 基因测序技术可以克服传统微生物多样性研究方法（如纯培养、理化鉴定）中的困难，对无法培养和难以鉴定的微生物进行研究。

     

    二、16S rRNA 基因测序技术的优势

    1. 高通量测序：16S rRNA 基因测序技术可以对微生物群落进行高通量测序，获取大量的微生物多样性信息。

    2. 物种鉴定：16S rRNA 基因序列具有较高的变异性和保守性，可以用于微生物物种鉴定和分类。

    3. 多样性分析：通过 16S rRNA 基因测序，可以分析微生物群落的物种多样性、遗传多样性和功能多样性，为微生物资源的挖掘和利用提供重要依据。

    4. 应用广泛：16S rRNA 基因测序技术在环境、能源、食品和人体健康等领域有着广泛的研究与应用。

     

    三、测序数据分析和功能预测

    1. 序列质量控制：对原始测序数据进行质量控制，包括去除低质量序列、去除接头序列等。

    2. 序列比对：将质控后的序列与已知的数据库（如 NCBI）进行比对，获得物种信息。

    3. 物种多样性分析：基于序列比对结果，统计各个物种在群落中的丰度和多样性指标（如香农指数、辛普森指数等）。

    4. 功能预测：结合基因注释数据库（如 KEGG、COG 等），对微生物群落的功能多样性进行分析。根据序列相似性、保守性等特点，预测微生物群落中的基因功能及其在生态系统中的作用。

    5. 代谢途径分析：基于功能预测结果，分析微生物群落中的代谢途径和相互作用关系，揭示微生物在生态系统中的功能及其调控机制。

     

    四、应用

    1. 环境微生物研究：通过对土壤、水体等环境样本进行 16S rRNA 基因测序，分析微生物群落的多样性，揭示微生物在环境中的作用及其对生态系统的影响。

    2. 人体微生物研究：对人体不同部位（如肠道、口腔等）的微生物群落进行 16S rRNA 基因测序，探讨微生物与人体健康和疾病的关系。

    3. 发酵产业：对发酵过程中的微生物群落进行 16S rRNA 基因测序，优化发酵条件，提高产率和降低污染。

    4. 农业微生物研究：对植物根际、叶面等部位的微生物群落进行 16S rRNA 基因测序，分析微生物在植物生长发育中的作用，为农业生产提供科学依据。

     

    上一篇：侴术雷教授团队Angew.丨双功能FEC！高性能Na-DIBs！
    评论 / 文明上网理性发言
    12条评论
    登录
    全部评论 / 我的评论
    最热 /  最新
    全部 3小时前 四川
    文字是人类用符号记录表达信息以传之久远的方式和工具。现代文字大多是记录语言的工具。人类往往先有口头的语言后产生书面文字，很多小语种，有语言但没有文字。文字的不同体现了国家和民族的书面表达的方式和思维不同。文字使人类进入有历史记录的文明社会。
    点赞12
    回复
    全部
    查看更多评论
    相关文章

    一文详解扫描电子显微镜(SEM)的工作原理及应用技术

    2023-10-08

    接触角测试（CA）的原理、样品制备要求及实际应用

    2023-11-16

    恒电流间歇滴定法GITT的基本原理以及测试教程

    2022-08-12

    TMA技术的基本概念、应用领域以及实际操作中的要点

    2023-12-06

    详解XRD多晶与单晶材料的差异

    2023-12-21

    热重分析（TG-DTG）曲线的几种解析方法

    2023-12-26

    项目推荐/Project
    微生物多样性测序

    微生物多样性测序

    热门文章/popular

    【科研干货】电化学表征：循环伏安法详解（上）

    晶体结构可视化软件 VESTA使用教程（下篇）

    手把手教你用ChemDraw 画化学结构式：基础篇

    电化学实验基础之电化学工作站篇 （二）三电极和两电极体系的搭建 和测试

    【科研干货】电化学表征：循环伏安法详解（下）

    基础理论丨一文了解XPS（概念、定性定量分析、分析方法、谱线结构）

    微信扫码分享文章

    意见反馈

    有奖举报

    商务合作

    ...

    更多

    公众号

    关注我们 了解更多

    小程序

    随时预约 掌握进度

    举报有奖

    TEL: 191-3608-6524

    如：在网络上恶意使用“测试狗”等相关关键词误导用户点击、恶意盗用测试狗商标、冒称官方工作人员等情形，请您向我们举报，经查实后，我们将给予您奖励。

    举报内容：

    200

    上传附件：
    文件格式不正确，请重新上传文件格式不正确，请重新上传文件格式不正确，请重新上传
    文件格式：jpg、jpeg、png、gif、tif、doc、docx、ppt、pptx、xls、xlsx、pdf、zip、rar
    联系方式
    姓名
    电话
    提交意见

    意见反馈

    Suggestions

    您可以在此留下您宝贵的意见，您的意见或问题反馈将会成为我们不断改进的动力。

    意见类型
    测试服务
    网站功能
    财务报账
    其他类型
    意见内容

    200

    联系方式
    姓名
    电话
    提交意见

    收起

    {{row.label}}

    未完成
    已完成
    01

    专属信用额度，先测后付0元下单

    02

    下单享高额积分，万千好礼免费兑

    ￥200
    200元无门槛优惠券
    立即激活 立即下单
    已使用
    已作废
    了解更多会员权益

    全流程在线可视化，便捷高效触手可及

    如下单过程中有任何疑问或需要帮助，请随时咨询专属顾问~
    9折
    9折无门槛优惠券

    支付一笔订单后可领取

    立即领取 立即下单
    已使用
    已作废

    免费测+惊喜盲盒+高额福利，多重福利大放送

    新人免费测

    双双开盲盒（100%中奖）

    邀请人专享

    受邀人专享

    立即邀请

    创建/加入团队，解锁定制化权益

    01

    1500元团队专属优惠券

    02

    万元大额信用额度，享先测后付

    03

    团队成员统一开票报销；

    04

    专业工程师课题专属服务

    领取成功，请下单
    请您支付一笔订单后才可以领取优惠券
    Document
    关于我们 新手帮助 测试干货 商务合作 基金查询 相关资质 模拟计算 现场测试 服务项目 科研绘图 同步辐射 电池行业

    联系方式/contact

    400-152-6858

    工作时间/work time

    09:00-18:00

    测试狗公众号

    关注我们 了解更多

    测试狗小程序

    随时预约 掌握进度

    蜀公网安备51010602000648号

    蜀ICP备17005822号-1

    成都世纪美扬科技有限公司

    Copyright@测试狗·科研服务

    友情链接

    模拟计算 仪器产品负氧离子监测中国炭黑网盐雾试验箱生物毒性检测仪测量仪器智能试剂柜凝胶测试仪