快捷下单入口 关于 合作 招聘 新人手册 会员中心

    热线:400-152-6858

    测试狗科研服务

    预存 免费试测 登录
    Document
    当前位置:文库百科文章详情
    Fullprof模块简介及精修相关问题
    来源:王小z XRD Refineme 时间:2020-05-31 09:11:27 浏览:6995次

    本文授权转载自王小z XRD Refinement

    Fullprof模块简介及精修相关问题


    Fullprof几乎每年都会进行更新,每个版本更新以及修改都可以在“FullProf_News_Year”中找到。最新的是在2020年5月更新的版本,全平台支持,且加入了很多新功能。这里就其一些新功能进行说明。

    1、PDF拟合

          新版本基于F语言,加入了PDF拟合模块(以前就有,该版本特别说明)。依据CIF文件提前编写好cfl文件,再调用终端窗口进行运行即可。这里只给出运行的范例,对该功能与PDFget等的数据处理结果不进行对比,有需要的小伙伴可以自己进行分析比较。用于拟合的cfl文件有简单的参考模板,可依据进行学习。

    2、层状材料精修

          Fullprof集成了FAULTS程序,该程序可用来计算缺陷层状晶体的衍射强度。该工具已被广泛用于解释一维无序系统的衍射数据,其算法利用在随机堆叠序列中发现的模式的递归性质来计算发生在每个层散射的平均扰动波函数。使用该软件可以很好的对LixNi1:02O2 (x ≤0.3) ,设置精修时,直接设定每层的原子位置,精修结果如图所示。

    3、GLOpSAnn(Global Optimization by Simulated Annealing)

          由粉末衍射数据获得int文件,然后依据int文件执行模拟退火获得PbSO4的晶体结构。int文件可通过Fullprof主程序获得,设置好参数后,解析结构获得CIF文件所需时间为2分钟,并直接给出BVS计算的键价结果;该程序相比Fullprof自带的模拟退火功能,在编写cfl后,加以键价的匹配,运行速度会更快。


    二、问题讲解


     Fullprof作为一款免费的晶体学软件,其重要的功能便是粉末衍射精修,然而该软件上手难,参考资料少,使用过程中总出现其特有的或是精修共有的一些问题,这里收集了部分后台留言问题,根据个人经验进行解答分析,不当之处请指正。

    问题1峰型不对称性如何修正?修正参数和GSAS的有何区别?

    解释:目前使用Fullprof进行粉末衍射精修,X射线衍射峰描述使用的是经验性的峰型函数“pseudo-Voigt”或者“Pearson VII”。该函数是不具备非对称性的,非对称性修正采用的是如下公式:

    方法1:如果使用的是“pseudo-Voigt”函数,需要在pcr文件中AsyLim给定非对称角度,代表修正低于给定角度的非对称性。比如:AsyLim 40,即代表:修正40°以下的非对称性。

    此时,可修正的参数为 P1, P2, P3, P4      

    修正前    

    修正后

    具体在软件中操作位置如下:


    方法2当然,大家可能发现在GSAS中修正参数常见的是S/D,其实这是使用另外一种峰型函数。“Thompson-Cox-Hastings pseudo-Voigt convoluted with axial divergence asymmetry”,当使用该函数描述峰型时,修正的参数即为S_L, D_L。对两个参数的定义如下:S_L is source width/detector distance;D_L is detector width/detector distance。在软件界面修正位置如下:



    问题2描述衍射峰型的参数U、V、W以及Eta等应该怎么选?

    解答:峰型描述是粉末精修中的一个难点。峰型拟合的好坏直接影响精修结果,且峰型含有诸多信息。这里我们以经验 “pV”函数为例进行说明。

    “pV”函数表达式如下:

    方法:精修默认初始值U = 0.004,V = -0.008,W = 0.006,Eta = 0, x = 0.018;这一系列数值是不能很好的描述常见的X衍射峰型的,因此对初始精修造成了一些困难,如果我们在精修之前就知道大致的峰型参数,再去精修,事情就会变得简单多了。Fullprof中的WinPLOTR可以实现我们的想法,具体操作如下:

    1. 打开WinPLOTR,打开要精修的数据;

    2. “Points Selection”——“Peak search”,选择doublets;

    3. “Calculations”——“Profile fitting”。进行峰型拟合,运行结束后如图所示,此时,拟合结果一般,继续拟合;

    4. 峰型拟合一般,返回工作目录下,打开.NEW文件,将“U、W、Eta”的Flag进行修改,随后进行如下步骤:“Calculations”——“Fit with.NEW”,选择修改后的.NEW文件,随后选择数据文件,运行结果如下:此时,chi2 = 13.21;

    5. 重复第四步,将“U、W、Eta、Bac.、以及FWHM”的Flag进行修改,经过多次循环,最终chi2 = 3.94,拟合结果如下图所示,同时,峰型描述的初始值我们已经得到,打开.NEW文件,找到U、V、W等参数,将该参数作为精修的初始参数即可。


    问题3精修后数据如何导出?怎么作图?

    回答:这一步虽然不难,但是对于新手也算是一个盲点。精修完成后需要将数据进行输出作图,谁不喜欢原创呢,谁愿意截图,涉及到的软件为Origin。

    1.精修完成之后,去精修目录找到.prf文件,使用WinPLOTR打开,打开如下,默认显示四种数据,红色框内所示;

    2. “File”——“Save data as”,选择XYY格式,保存;

    3. 将数据导入Origin,如下:

    4. 全选所有数据,作图使用“Line”模式,如下:

    5. 选中图形,右键“Ungroup”,将每个数据进行区分;然后双击数据线进行格式修改;

    6. Yobs选中Scatter,颜色和样式依据个人喜好,这里我选择的是红色圆圈;

    7. 其余的Ycalc和Yobs-Ycalc都是line模式,颜色我这里选择的分别是黑色和蓝色;

    8. Bragg_position,选择Scatter,下拉选择“小竖线”,修改颜色和粗细即可;修改后结果如下:


    9. 最后调整一下字体,边框粗细和坐标范围即可,最终结果如下;

    10. 为了便于作图,可将该图形保存为模板,下次作图一键使用模板即可,方便快捷。

    免责声明:本资源来源于王小z XRD Refinement,版权归原作者所有,本文仅作交流学习之用,不作任何商业用途,若有侵权,请联系删除,谢谢理解!

    评论 / 文明上网理性发言
    12条评论
    全部评论 / 我的评论
    最热 /  最新
    全部 3小时前 四川
    文字是人类用符号记录表达信息以传之久远的方式和工具。现代文字大多是记录语言的工具。人类往往先有口头的语言后产生书面文字,很多小语种,有语言但没有文字。文字的不同体现了国家和民族的书面表达的方式和思维不同。文字使人类进入有历史记录的文明社会。
    点赞12
    回复
    全部
    查看更多评论
    相关文章

    【科研干货】电化学表征:循环伏安法详解(上)

    2019-10-25

    晶体结构可视化软件 VESTA使用教程(下篇)

    2021-01-22

    手把手教你用ChemDraw 画化学结构式:基础篇

    2021-06-19

    【科研干货】电化学表征:循环伏安法详解(下)

    2019-10-25

    基础理论丨一文了解XPS(概念、定性定量分析、分析方法、谱线结构)

    2020-05-03

    Zeta电位的基本理论、测试方法和应用

    2020-08-24

    项目推荐/Project
    XRD数据精修

    XRD数据精修

    热门文章/popular

    【科研干货】电化学表征:循环伏安法详解(上)

    晶体结构可视化软件 VESTA使用教程(下篇)

    手把手教你用ChemDraw 画化学结构式:基础篇

    电化学实验基础之电化学工作站篇 (二)三电极和两电极体系的搭建 和测试

    【科研干货】电化学表征:循环伏安法详解(下)

    基础理论丨一文了解XPS(概念、定性定量分析、分析方法、谱线结构)

    微信扫码分享文章

    意见反馈

    有奖举报

    商务合作

    ...

    更多

    公众号

    关注我们 了解更多

    小程序

    随时预约 掌握进度

    举报有奖

    TEL: 191-3608-6524

    如:在网络上恶意使用“测试狗”等相关关键词误导用户点击、恶意盗用测试狗商标、冒称官方工作人员等情形,请您向我们举报,经查实后,我们将给予您奖励。

    举报内容:

    200

    上传附件:
    文件格式不正确,请重新上传文件格式不正确,请重新上传文件格式不正确,请重新上传
    文件格式:jpg、jpeg、png、gif、tif、doc、docx、ppt、pptx、xls、xlsx、pdf、zip、rar
    联系方式
    姓名
    电话
    提交意见

    意见反馈

    Suggestions

    您可以在此留下您宝贵的意见,您的意见或问题反馈将会成为我们不断改进的动力。

    意见类型
    测试服务
    网站功能
    财务报账
    其他类型
    意见内容

    200

    联系方式
    姓名
    电话
    提交意见

    收起

    01

    专属信用额度,先测后付0元下单

    02

    下单享高额积分,万千好礼免费兑

    200
    200元无门槛优惠券
    立即激活 立即下单
    已使用
    已作废

    全流程在线可视化,便捷高效触手可及

    如下单过程中有任何疑问或需要帮助,请随时咨询专属顾问~
    9
    9折无门槛优惠券

    支付一笔订单后可领取

    立即领取 立即下单
    已使用
    已作废

    免费测+惊喜盲盒+高额福利,多重福利大放送

    新人免费测

    双双开盲盒(100%中奖)

    邀请人专享

    受邀人专享

    创建/加入团队,解锁定制化权益

    01

    1500元团队专属优惠券

    02

    万元大额信用额度,享先测后付

    03

    团队成员统一开票报销;

    04

    专业工程师课题专属服务

    领取成功,请下单
    请您支付一笔订单后才可以领取优惠券
    Document
    关于我们 新手帮助 测试干货 商务合作 基金查询 相关资质 模拟计算 现场测试 服务项目 科研绘图 同步辐射 电池行业

    联系方式/contact

    400-152-6858

    工作时间/work time

    09:00-18:00

    测试狗公众号

    关注我们 了解更多

    测试狗小程序

    随时预约 掌握进度

    蜀公网安备51010602000648号

    蜀ICP备17005822号-1

    成都世纪美扬科技有限公司

    Copyright@测试狗·科研服务